| 2009年6月 | 文部科学省のグローバルCOEプログラム（国際的に卓越した教育研究拠点形成のための重点的支援）の１つとして、地球生命研究所の前身となる拠点プログラム「地球から地球たちへ」が採択 |
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| 2012年10月 | 文部科学省「世界トップレベル研究拠点プログラム（WPI）」に地球生命研究所の採択が決定 |
| 2012年12月 | 地球生命研究所設立 |
| 2013年3月 | 開所式、第1回 国際シンポジウム開催 |
| 2014年3月 | 第2回国際シンポジウム Origin & Evolution of the Earth-Life System 開催 |
| 2014年8月 | サマースクール開催 |
| 2015年1月 | 第3回国際シンポジウム Life in the Universe、一般講演会「宇宙に生命はいるのか」を開催 |
| 2015年4月 | 米国ジョン・テンプルトン財団からの助成金を受け、ELSI Origins Network (EON)発足（2017年12月まで） |
| 2015年10月 | 地球生命研究所新研究棟完成式典 |
| 2016年1月 |
第4回国際シンポジウム Early Earth, Venus, and Mars: Three Experiments in Biological Origins、一般講演会「宇宙に生命を探して」を開催 東京大学カブリ数物連携宇宙研究機構（Kavli-IPMU）との共催で一般講演会「起源への問い」第１回を開催 |
| 2017年1月 |
第5回国際シンポジウム Expanding Views on the Emergence of the Biosphere、一般講演会「私たちはまだ私たちの"はじまり"を知らない ～生命の起源に迫る宇宙生物学の可能性～」を開催 Kavli-IPMU・地球生命研究所共催、一般講演会「起源への問い」第2回を開催 |
| 2018年1月 |
第6回国際シンポジウム Building Bridges from Earth to Life: From Chemical Mechanism to Ancient Biology、一般講演会を開催 Kavli-IPMU・地球生命研究所共催、一般講演会「起源への問い」第3回を開催 EON-ELSI ウィンタースクール開催 |
| 2018年4月 |
Japan SciCom 2018を主催 |
| 2019年1月 |
第7回国際シンポジウム Comparative Emergence、一般講演会「太陽系探査の最前線 ～新たな出会いを求めて～」を開催 「三島ホール」命名・除幕式 東京大学Kavli-IPMU、ニューロインテリジェンス国際研究機構（IRCN）、地球生命研究所共催、一般講演会「起源への問い」第４回を開催 |
| 2019年5月 | Japan SciCom 2019を主催 |
| 2020年2月 |
第8回国際シンポジウム Extending Views of Catalysis、一般講演会「極限環境の生物たち ～生命の神秘に魅せられて～」を開催 東京大学Kavli-IPMU、IRCN、地球生命研究所共催、一般講演会「起源への問い」第5回を開催 |
| 2021年1月 |
第8回国際シンポジウム Science in Society、 一般講演会「フィールドで科学する」を開催 |
| 2021年2月 |
第9回WPIサイエンスシンポジウム「21世紀の『生命』研究」を開催 東京大学Kavli-IPMU、IRCN、地球生命研究所共催、一般講演会「起源への問い」第6回を開催 |
| 2021年9月 |
Astrobiology Graduate Conference (AbGradCon) 2021を主催 |